しかし、そのブームが過ぎ去った後、サンフレッチェにも当然のように暗黒時代が到来する。悪い事は連鎖し、クラブの筆頭株主でメインスポンサーでもある自動車メーカーのマツダも経営難に陥る。前身のマツダSC時代からの親会社の経営不振により、クラブは主力選手の大量放出に踏み切り、1997年オフにはFW高木琢也・FW盧廷潤・DF路木龍次が退団。現役だったMF森保一（現監督）も期限付き移籍でチームを離れた。翌年にも当時の日本代表の主力だったDF柳本啓成までもが退団する。
しかし、そのブームが過ぎ去った後、サンフレッチェにも当然のように暗黒時代が到来する。悪い事は連鎖し、クラブの筆頭株主でメインスポンサーでもある自動車メーカーのマツダも経営難に陥る。前身のマツダSC時代からの親会社の経営不振により、クラブは主力選手の大量放出に踏み切り、1997年オフにはFW高木琢也・FW盧廷潤・DF路木龍次が退団。現役だったMF森保一（現監督）も期限付き移籍でチームを離れた。翌年にも当時の日本代表の主力だったDF柳本啓成までもが退団する。